Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7B6

PACRGL, PACRG-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGLQ8N7B6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACRGLQ8N7B6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACRGLQ8N7B6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACRGLQ8N7B6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms