Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00337Q8N6G1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00337Q8N6G1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms