Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1KQ8N3J5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1KQ8N3J5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1KQ8N3J5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1KQ8N3J5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1KQ8N3J5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1KQ8N3J5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1KQ8N3J5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1KQ8N3J5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1KQ8N3J5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPM1KQ8N3J5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms