Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4X1Q8N118 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4X1Q8N118 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4X1Q8N118 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms