Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCE1Q8N0S2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE1Q8N0S2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms