Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC3Q7Z5M5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC3Q7Z5M5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMC3Q7Z5M5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms