Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.77■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BRINP3Q76B58 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRINP3Q76B58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
BRINP3Q76B58 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRINP3Q76B58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms