Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRN1Q6UXK5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRN1Q6UXK5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms