Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC25A47Q6Q0C1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A47Q6Q0C1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A47Q6Q0C1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A47Q6Q0C1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A47Q6Q0C1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A47Q6Q0C1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A47Q6Q0C1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms