Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD18Q6PI47 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KCTD18Q6PI47 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCTD18Q6PI47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms