Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC12Q6PEW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZCCHC12Q6PEW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms