Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KANK3Q6NY19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KANK3Q6NY19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KANK3Q6NY19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KANK3Q6NY19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms