Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMBOX1Q6NT76 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMBOX1Q6NT76 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms