Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST2H2AA3Q6FI13 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST2H2AA3Q6FI13 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIST2H2AA3Q6FI13 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIST2H2AA3Q6FI13 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIST2H2AA3Q6FI13 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIST2H2AA3Q6FI13 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H2AA3Q6FI13 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms