Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUMO4Q6EEV6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms