Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC19Q6DKK2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC19Q6DKK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms