Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L1Q676U5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG16L1Q676U5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.9 ms