Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM236Q5W0B7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM236Q5W0B7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM236Q5W0B7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms