Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIPNQ5VXI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LIPNQ5VXI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPNQ5VXI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIPNQ5VXI9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIPNQ5VXI9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPNQ5VXI9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPNQ5VXI9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPNQ5VXI9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPNQ5VXI9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms