Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GKAP1Q5VSY0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GKAP1Q5VSY0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GKAP1Q5VSY0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms