Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms