Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FRMPD1Q5SYB0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
FRMPD1Q5SYB0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FRMPD1Q5SYB0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms