Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms