Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM201Q5SNT2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM201Q5SNT2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms