Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HSD17B12Q53GQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms