Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC23Q53EV4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC23Q53EV4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms