Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
LONRF3Q496Y0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LONRF3Q496Y0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF3Q496Y0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms