Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC153Q494R4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms