Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3C1V9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Q3C1V9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3C1V9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q3C1V9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q3C1V9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q3C1V9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q3C1V9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Q3C1V9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3C1V9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3C1V9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3C1V9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3C1V9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3C1V9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3C1V9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3C1V9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3C1V9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3C1V9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3C1V9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3C1V9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3C1V9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3C1V9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3C1V9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3C1V9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3C1V9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3C1V9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3C1V9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3C1V9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3C1V9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3C1V9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Q3C1V9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3C1V9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3C1V9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3C1V9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3C1V9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3C1V9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3C1V9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3C1V9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3C1V9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3C1V9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3C1V9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3C1V9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3C1V9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3C1V9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3C1V9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3C1V9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3C1V9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3C1V9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3C1V9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3C1V9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3C1V9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3C1V9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3C1V9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3C1V9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3C1V9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3C1V9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3C1V9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3C1V9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3C1V9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3C1V9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3C1V9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3C1V9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q3C1V9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q3C1V9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q3C1V9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q3C1V9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Q3C1V9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3C1V9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3C1V9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3C1V9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3C1V9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3C1V9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3C1V9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q3C1V9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q3C1V9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q3C1V9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q3C1V9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3C1V9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3C1V9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3C1V9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3C1V9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3C1V9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3C1V9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3C1V9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3C1V9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3C1V9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3C1V9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q3C1V9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3C1V9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3C1V9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3C1V9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3C1V9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms