Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-BQ31612 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-BQ31612 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms