Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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RAB11BQ15907 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RAB11BQ15907 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RAB11BQ15907 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB11BQ15907 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RAB11BQ15907 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RAB11BQ15907 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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RAB11BQ15907 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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RAB11BQ15907 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB11BQ15907 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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