Protein–RNA interactions for Protein: Q13571

LAPTM5, Lysosomal-associated transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM5Q13571 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM5Q13571 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM5Q13571 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM5Q13571 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM5Q13571 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM5Q13571 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM5Q13571 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAPTM5Q13571 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM5Q13571 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM5Q13571 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM5Q13571 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM5Q13571 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM5Q13571 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM5Q13571 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM5Q13571 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM5Q13571 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAPTM5Q13571 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms