Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPAN31Q12999 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN31Q12999 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms