Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXC1Q12948 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXC1Q12948 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXC1Q12948 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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