Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNMA1Q12791 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNMA1Q12791 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNMA1Q12791 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms