Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 TAF9YMR236W 474 nt7.25□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 VPS5YOR069W 2028 nt7.24□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 MNN5YJL186W 1761 nt7.24□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 BUG1YDL099W 1026 nt7.24□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 MPH3YJR160C 1809 nt7.24□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 RSA4YCR072C 1548 nt7.23□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 YOR268CYOR268C 399 nt7.23□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 DAP1YPL170W 459 nt7.23□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 CSC1YLR241W 2349 nt7.23□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 RPT3YDR394W 1287 nt7.22□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 RPS3YNL178W 723 nt7.22□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 VMA4YOR332W 702 nt7.22□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 CYS4YGR155W 1524 nt7.22□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 ESC8YOL017W 2145 nt7.21□□□□□ -1.25
LSP1Q12230 PAT1YCR077C 2391 nt7.21□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 YBR284WYBR284W 2394 nt7.21□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 SAL1YNL083W 1485 nt7.21□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 NHA1YLR138W 2958 nt7.21□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 MTC5YDR128W 3447 nt7.2□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 AIM3YBR108W 2844 nt7.2□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 YCK1YHR135C 1617 nt7.2□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 PKC1YBL105C 3456 nt7.2□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 SSK22YCR073C 3996 nt7.2□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 YKR045CYKR045C 552 nt7.2□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 MRPS12YNR036C 462 nt7.2□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 RGT2YDL138W 2292 nt7.19□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 snR82snR82 268 nt7.19□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 MHT1YLL062C 975 nt7.19□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 MRPS18YNL306W 654 nt7.19□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 PLB3YOL011W 2061 nt7.19□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 SLX5YDL013W 1860 nt7.19□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 GUD1YDL238C 1470 nt7.18□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 HDA1YNL021W 2121 nt7.18□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 IFA38YBR159W 1044 nt7.18□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 ACS1YAL054C 2142 nt7.18□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 MCH1YDL054C 1461 nt7.17□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 RMD9YGL107C 1941 nt7.17□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 OM45YIL136W 1182 nt7.17□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 FPR3YML074C 1236 nt7.17□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 LAG2YOL025W 1983 nt7.17□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 HAS1YMR290C 1518 nt7.17□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 GCG1YER163C 699 nt7.16□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 RPE1YJL121C 717 nt7.16□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 AAD14YNL331C 1131 nt7.16□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 POP1YNL221C 2628 nt7.16□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 CLB2YPR119W 1476 nt7.16□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 DPH5YLR172C 903 nt7.15□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 RRS1YOR294W 612 nt7.15□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 NHP6BYBR089C-A 300 nt7.15□□□□□ -1.26
LSP1Q12230 IVY1YDR229W 1362 nt7.14□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 YFL042CYFL042C 2025 nt7.14□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 HXK2YGL253W 1461 nt7.14□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 BCY1YIL033C 1251 nt7.14□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 GLC8YMR311C 690 nt7.14□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 HST3YOR025W 1344 nt7.14□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 YMR279CYMR279C 1623 nt7.13□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 SDH4YDR178W 546 nt7.13□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 YJR084WYJR084W 1272 nt7.13□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 ILV6YCL009C 930 nt7.13□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 PYC2YBR218C 3543 nt7.13□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 YDR387CYDR387C 1668 nt7.12□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 NMT1YLR195C 1368 nt7.12□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 TSR2YLR435W 618 nt7.12□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 PUS4YNL292W 1212 nt7.12□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 KKQ8YKL168C 2175 nt7.12□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 GAT1YFL021W 1533 nt7.11□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 MCM3YEL032W 2916 nt7.11□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 UIP5YKR044W 1332 nt7.11□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 YGR127WYGR127W 939 nt7.11□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 URA1YKL216W 945 nt7.11□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 ZWF1YNL241C 1518 nt7.11□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 WHI2YOR043W 1461 nt7.11□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 EFT2YDR385W 2529 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 EFT1YOR133W 2529 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 ERG8YMR220W 1356 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 CYC8YBR112C 2901 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 RAD59YDL059C 717 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 RPL7AYGL076C 735 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 ECM14YHR132C 1293 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 COS10YNR075W 1125 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 RPL7BYPL198W 735 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 KTR5YNL029C 1569 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 GYP8YFL027C 1494 nt7.1□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 RPL10YLR075W 666 nt7.09□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 PAB1YER165W 1734 nt7.09□□□□□ -1.27
LSP1Q12230 PXL1YKR090W 2121 nt7.08□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 KEX2YNL238W 2445 nt7.08□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 GPB2YAL056W 2643 nt7.08□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 ALT2YDR111C 1524 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 FRS2YFL022C 1512 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 POX1YGL205W 2247 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 THI4YGR144W 981 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SUP2tY(GUA)D 75 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SUP11tY(GUA)F1 75 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SUP6tY(GUA)F2 75 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SUP7tY(GUA)J1 75 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SUP4tY(GUA)J2 75 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SUP5tY(GUA)M1 75 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SUP8tY(GUA)M2 75 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SUP3tY(GUA)O 75 nt7.07□□□□□ -1.28
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