Protein–RNA interactions for Protein: Q07457

BRE1, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE1Q07457 PTC4YBR125C 1182 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 YMR279CYMR279C 1623 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 FRE5YOR384W 2085 nt7.58□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 POR2YIL114C 846 nt7.57□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 TFB4YPR056W 1017 nt7.57□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 MSS1YMR023C 1581 nt7.57□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 MPC2YHR162W 390 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 GTO3YMR251W 1101 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 SGF29YCL010C 780 nt7.56□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 PMT3YOR321W 2262 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 YDR401WYDR401W 564 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 RPP1YHR062C 882 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 TDH2YJR009C 999 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 ECM31YBR176W 939 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 DEF1YKL054C 2217 nt7.55□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 HXT17YNR072W 1695 nt7.54□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 PPT1YGR123C 1542 nt7.54□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 YDL023CYDL023C 321 nt7.54□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.54□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 PEX3YDR329C 1326 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 RRP9YPR137W 1722 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 AIM24YJR080C 1185 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 VTS1YOR359W 1572 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 EDC3YEL015W 1656 nt7.53□□□□□ -1.2
BRE1Q07457 HSP12YFL014W 330 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 BNS1YGR230W 414 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 MEH1YKR007W 555 nt7.52□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 ATG17YLR423C 1254 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 SMK1YPR054W 1167 nt7.51□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 MSP1YGR028W 1089 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YLR123CYLR123C 330 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YLR312CYLR312C 1197 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 FPR3YML074C 1236 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 RRN10YBL025W 438 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 SCS7YMR272C 1155 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 UTR2YEL040W 1404 nt7.5□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YLR463CYLR463C 552 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 COX5AYNL052W 462 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YPR196WYPR196W 1413 nt7.49□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 SES1YDR023W 1389 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 SDH4YDR178W 546 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 IMD1YAR073W 1212 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 SUR7YML052W 909 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 GLC8YMR311C 690 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 RKI1YOR095C 777 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 ECM38YLR299W 1983 nt7.48□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YMR027WYMR027W 1413 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YJR084WYJR084W 1272 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YMR295CYMR295C 594 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 COQ3YOL096C 939 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 SRP101YDR292C 1866 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YOR389WYOR389W 1875 nt7.47□□□□□ -1.21
BRE1Q07457 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 ERP2YAL007C 648 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 VPS24YKL041W 675 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 YML018CYML018C 1182 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 OST3YOR085W 1053 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 BDF2YDL070W 1917 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 ARP3YJR065C 1350 nt7.46□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 SLX5YDL013W 1860 nt7.45□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 ICL2YPR006C 1728 nt7.45□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 RAD59YDL059C 717 nt7.45□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 AAT2YLR027C 1257 nt7.45□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 RVB2YPL235W 1416 nt7.44□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 FYV1YDR024W 486 nt7.44□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 LAG2YOL025W 1983 nt7.44□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 LCB3YJL134W 1230 nt7.43□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 MEU1YLR017W 1014 nt7.43□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 RPS3YNL178W 723 nt7.43□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 AMD2YDR242W 1650 nt7.43□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 YPR204WYPR204W 3099 nt7.43□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 HIS7YBR248C 1659 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 DRS1YLL008W 2259 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 BUG1YDL099W 1026 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 QCR8YJL166W 285 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 YJL211CYJL211C 444 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 PSR2YLR019W 1194 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 RNH201YNL072W 924 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 MRPL10YNL284C 969 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 FSF1YOR271C 984 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 ARO7YPR060C 771 nt7.42□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 TKL2YBR117C 2046 nt7.41□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 HVG1YER039C 750 nt7.41□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 TIF2YJL138C 1188 nt7.41□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 TIF1YKR059W 1188 nt7.41□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 KTR1YOR099W 1182 nt7.41□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 CHL4YDR254W 1377 nt7.41□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 HRQ1YDR291W 3234 nt7.41□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 TOM20YGR082W 552 nt7.4□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 CTF8YHR191C 402 nt7.4□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 RDL2YOR286W 450 nt7.4□□□□□ -1.22
BRE1Q07457 ASN1YPR145W 1719 nt7.4□□□□□ -1.23
BRE1Q07457 ATG7YHR171W 1893 nt7.39□□□□□ -1.23
BRE1Q07457 ERG1YGR175C 1491 nt7.39□□□□□ -1.23
BRE1Q07457 ENP1YBR247C 1452 nt7.39□□□□□ -1.23
BRE1Q07457 CRF1YDR223W 1404 nt7.39□□□□□ -1.23
BRE1Q07457 IES2YNL215W 963 nt7.39□□□□□ -1.23
BRE1Q07457 RPO26YPR187W 468 nt7.39□□□□□ -1.23
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