Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF11Q05519 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRSF11Q05519 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF11Q05519 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF11Q05519 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF11Q05519 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF11Q05519 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF11Q05519 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF11Q05519 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF11Q05519 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF11Q05519 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF11Q05519 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms