Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 MEH1YKR007W 555 nt5.84□□□□□ -1.47
NUP49Q02199 YAR064WYAR064W 300 nt5.84□□□□□ -1.47
NUP49Q02199 HRQ1YDR291W 3234 nt5.84□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 KEL1YHR158C 3495 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 PGK1YCR012W 1251 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 FZF1YGL254W 900 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 MRS1YIR021W 1092 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 YKL102CYKL102C 306 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 TMT1YER175C 900 nt5.82□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 ASF1YJL115W 840 nt5.82□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 YBL070CYBL070C 321 nt5.82□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 CTF19YPL018W 1110 nt5.82□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 EHD3YDR036C 1503 nt5.82□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 snR82snR82 268 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 VMA3YEL027W 483 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 YGR127WYGR127W 939 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 POP5YAL033W 522 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 LSC1YOR142W 990 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 DAP1YPL170W 459 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 HXT15YDL245C 1704 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 HXT16YJR158W 1704 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 HXK2YGL253W 1461 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 MRC1YCL061C 3291 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 ATG22YCL038C 1587 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 CYS4YGR155W 1524 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 CNE1YAL058W 1509 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 HAS1YMR290C 1518 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 PYC2YBR218C 3543 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 SLX5YDL013W 1860 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 FMO1YHR176W 1299 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 YDR387CYDR387C 1668 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 CLB2YPR119W 1476 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 HDA1YNL021W 2121 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 YFL042CYFL042C 2025 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 VPS4YPR173C 1314 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 GPD1YDL022W 1176 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 LCL3YGL085W 825 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 YGL235WYGL235W 537 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 CCT8YJL008C 1707 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 SRL2YLR082C 1179 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 ATP4YPL078C 735 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 PET112YBL080C 1626 nt5.77□□□□□ -1.48
NUP49Q02199 MTC5YDR128W 3447 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 THI4YGR144W 981 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 MSO1YNR049C 633 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 YOL163WYOL163W 510 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 YMC1YPR058W 924 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 MNN5YJL186W 1761 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 IVY1YDR229W 1362 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 YTP1YNL237W 1380 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 YFR006WYFR006W 1608 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 ATF1YOR377W 1578 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 NSE5YML023C 1671 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 RPL7AYGL076C 735 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 GTO3YMR251W 1101 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 RPL7BYPL198W 735 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 AMD2YDR242W 1650 nt5.75□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 MRPL35YDR322W 1104 nt5.75□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 TAF9YMR236W 474 nt5.75□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 MRPS12YNR036C 462 nt5.75□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 PTC4YBR125C 1182 nt5.75□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 PPT1YGR123C 1542 nt5.74□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 MRPS18YNL306W 654 nt5.74□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 PAT1YCR077C 2391 nt5.74□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 EXG1YLR300W 1347 nt5.74□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 VHT1YGR065C 1782 nt5.72□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 HXT17YNR072W 1695 nt5.72□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 SAL1YNL083W 1485 nt5.72□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 PAB1YER165W 1734 nt5.72□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 TEP1YNL128W 1305 nt5.72□□□□□ -1.49
NUP49Q02199 YCK1YHR135C 1617 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 GCG1YER163C 699 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 RPE1YJL121C 717 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 VMA4YOR332W 702 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 IFA38YBR159W 1044 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 KEX2YNL238W 2445 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 PTK2YJR059W 2457 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 PXL1YKR090W 2121 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 GUD1YDL238C 1470 nt5.71□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 AMA1YGR225W 1782 nt5.7□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 HIS7YBR248C 1659 nt5.7□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 OM45YIL136W 1182 nt5.7□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 GPD2YOL059W 1323 nt5.7□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 BUG1YDL099W 1026 nt5.69□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 RPT3YDR394W 1287 nt5.69□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.69□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 YKR045CYKR045C 552 nt5.69□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 CCP1YKR066C 1086 nt5.69□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 MHT1YLL062C 975 nt5.69□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.69□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 MCH1YDL054C 1461 nt5.69□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 CLB1YGR108W 1416 nt5.68□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 TSR2YLR435W 618 nt5.68□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 GLN1YPR035W 1113 nt5.68□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 ILV6YCL009C 930 nt5.68□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 ERG8YMR220W 1356 nt5.67□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 PTC3YBL056W 1407 nt5.67□□□□□ -1.5
NUP49Q02199 RPN11YFR004W 921 nt5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.7 ms