Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DEFA6Q01524 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEFA6Q01524 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms