Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF9Q00978 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF9Q00978 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 717 ms