Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
FANCCQ00597 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FANCCQ00597 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms