Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NOMO3P69849 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOMO3P69849 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOMO3P69849 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOMO3P69849 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms