Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPS29P62273 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPS29P62273 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RPS29P62273 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RPS29P62273 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RPS29P62273 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RPS29P62273 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RPS29P62273 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RPS29P62273 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RPS29P62273 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RPS29P62273 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RPS29P62273 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RPS29P62273 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RPS29P62273 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RPS29P62273 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RPS29P62273 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RPS29P62273 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RPS29P62273 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RPS29P62273 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RPS29P62273 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RPS29P62273 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RPS29P62273 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS29P62273 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS29P62273 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS29P62273 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS29P62273 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS29P62273 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RPS29P62273 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS29P62273 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS29P62273 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS29P62273 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS29P62273 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS29P62273 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS29P62273 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPS29P62273 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPS29P62273 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPS29P62273 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS29P62273 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS29P62273 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS29P62273 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS29P62273 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS29P62273 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS29P62273 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS29P62273 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPS29P62273 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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