Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA6P60900 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA6P60900 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA6P60900 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA6P60900 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA6P60900 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA6P60900 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA6P60900 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA6P60900 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA6P60900 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA6P60900 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms