Protein–RNA interactions for Protein: P56703

WNT3, Proto-oncogene Wnt-3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3P56703 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WNT3P56703 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3P56703 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3P56703 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3P56703 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3P56703 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3P56703 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3P56703 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3P56703 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WNT3P56703 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3P56703 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3P56703 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3P56703 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3P56703 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WNT3P56703 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WNT3P56703 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WNT3P56703 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
WNT3P56703 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3P56703 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3P56703 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WNT3P56703 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3P56703 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3P56703 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WNT3P56703 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3P56703 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3P56703 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3P56703 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3P56703 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3P56703 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3P56703 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3P56703 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WNT3P56703 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3P56703 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3P56703 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3P56703 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3P56703 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3P56703 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3P56703 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3P56703 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3P56703 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3P56703 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3P56703 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3P56703 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3P56703 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3P56703 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3P56703 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3P56703 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3P56703 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3P56703 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3P56703 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3P56703 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3P56703 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3P56703 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3P56703 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3P56703 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3P56703 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WNT3P56703 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3P56703 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3P56703 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3P56703 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3P56703 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3P56703 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3P56703 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3P56703 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3P56703 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3P56703 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3P56703 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3P56703 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3P56703 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3P56703 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3P56703 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3P56703 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3P56703 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3P56703 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3P56703 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3P56703 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3P56703 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3P56703 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3P56703 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms