Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH12P55289 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH12P55289 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH12P55289 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH12P55289 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH12P55289 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH12P55289 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH12P55289 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH12P55289 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH12P55289 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH12P55289 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH12P55289 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH12P55289 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH12P55289 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH12P55289 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH12P55289 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH12P55289 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH12P55289 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH12P55289 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH12P55289 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH12P55289 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH12P55289 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH12P55289 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH12P55289 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH12P55289 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH12P55289 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH12P55289 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH12P55289 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH12P55289 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH12P55289 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH12P55289 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH12P55289 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH12P55289 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH12P55289 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH12P55289 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH12P55289 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH12P55289 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH12P55289 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH12P55289 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH12P55289 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH12P55289 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH12P55289 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH12P55289 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH12P55289 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH12P55289 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH12P55289 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH12P55289 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH12P55289 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH12P55289 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH12P55289 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH12P55289 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH12P55289 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH12P55289 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH12P55289 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH12P55289 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH12P55289 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH12P55289 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH12P55289 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH12P55289 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH12P55289 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH12P55289 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH12P55289 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH12P55289 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH12P55289 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH12P55289 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH12P55289 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH12P55289 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH12P55289 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH12P55289 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH12P55289 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH12P55289 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH12P55289 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH12P55289 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH12P55289 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH12P55289 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms