Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH11P55287 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH11P55287 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH11P55287 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH11P55287 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH11P55287 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH11P55287 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH11P55287 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH11P55287 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH11P55287 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH11P55287 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH11P55287 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH11P55287 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH11P55287 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH11P55287 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH11P55287 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH11P55287 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH11P55287 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH11P55287 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH11P55287 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH11P55287 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH11P55287 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH11P55287 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH11P55287 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH11P55287 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH11P55287 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH11P55287 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH11P55287 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH11P55287 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH11P55287 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH11P55287 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH11P55287 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH11P55287 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH11P55287 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH11P55287 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH11P55287 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH11P55287 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH11P55287 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH11P55287 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH11P55287 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH11P55287 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH11P55287 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH11P55287 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH11P55287 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH11P55287 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH11P55287 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH11P55287 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH11P55287 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH11P55287 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH11P55287 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH11P55287 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH11P55287 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH11P55287 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH11P55287 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH11P55287 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH11P55287 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH11P55287 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH11P55287 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH11P55287 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH11P55287 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH11P55287 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH11P55287 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH11P55287 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH11P55287 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH11P55287 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH11P55287 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH11P55287 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH11P55287 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH11P55287 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH11P55287 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH11P55287 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH11P55287 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH11P55287 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH11P55287 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH11P55287 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH11P55287 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH11P55287 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH11P55287 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH11P55287 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms