Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDT6P53370 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT6P53370 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDT6P53370 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms