Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEK4P51957 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEK4P51957 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEK4P51957 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEK4P51957 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK4P51957 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK4P51957 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK4P51957 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK4P51957 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEK4P51957 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEK4P51957 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK4P51957 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK4P51957 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK4P51957 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK4P51957 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK4P51957 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK4P51957 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK4P51957 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEK4P51957 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEK4P51957 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEK4P51957 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEK4P51957 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK4P51957 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK4P51957 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK4P51957 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK4P51957 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK4P51957 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK4P51957 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK4P51957 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK4P51957 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK4P51957 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK4P51957 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK4P51957 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK4P51957 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK4P51957 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK4P51957 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK4P51957 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK4P51957 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK4P51957 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK4P51957 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK4P51957 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK4P51957 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK4P51957 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK4P51957 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK4P51957 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK4P51957 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK4P51957 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK4P51957 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK4P51957 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEK4P51957 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEK4P51957 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEK4P51957 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEK4P51957 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEK4P51957 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEK4P51957 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEK4P51957 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEK4P51957 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK4P51957 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK4P51957 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK4P51957 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK4P51957 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK4P51957 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK4P51957 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK4P51957 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK4P51957 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK4P51957 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK4P51957 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK4P51957 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK4P51957 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK4P51957 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK4P51957 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK4P51957 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK4P51957 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK4P51957 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK4P51957 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK4P51957 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK4P51957 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK4P51957 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK4P51957 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK4P51957 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK4P51957 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK4P51957 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK4P51957 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK4P51957 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK4P51957 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK4P51957 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK4P51957 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK4P51957 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEK4P51957 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEK4P51957 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEK4P51957 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEK4P51957 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK4P51957 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK4P51957 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK4P51957 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK4P51957 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK4P51957 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK4P51957 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK4P51957 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK4P51957 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms